Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkx1-2P42580 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms