Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VhlP40338 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VhlP40338 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VhlP40338 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VhlP40338 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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