Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3rP40223 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf3rP40223 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms