Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf2P39429 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf2P39429 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms