Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik2P39087 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms