Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ppm1bP36993 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms