Protein–RNA interactions for Protein: P36423

Tbxas1, Thromboxane-A synthase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbxas1P36423 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tbxas1P36423 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms