Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms