Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ddit3P35639 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ddit3P35639 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms