Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Grin2aP35436 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Grin2aP35436 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Grin2aP35436 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms