Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sftpa1P35242 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms