Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ptpn11P35235 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn11P35235 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms