Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnar1P33896 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms