Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nedd1P33215 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nedd1P33215 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms