Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VtnP29788 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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