Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms