Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprmP28828 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
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