Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms