Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms