Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gria1P23818 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms