Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkchP23298 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PrkchP23298 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms