Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms