Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms