Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ms4a2P20490 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms