Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fcer1aP20489 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Fcer1aP20489 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Fcer1aP20489 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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