Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NefhP19246 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NefhP19246 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NefhP19246 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NefhP19246 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NefhP19246 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NefhP19246 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NefhP19246 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms