Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RargP18911 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RargP18911 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RargP18911 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RargP18911 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RargP18911 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RargP18911 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RargP18911 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RargP18911 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RargP18911 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RargP18911 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RargP18911 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RargP18911 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RargP18911 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RargP18911 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RargP18911 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RargP18911 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RargP18911 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms