Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata1P17679 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata1P17679 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms