Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp54P14576 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp54P14576 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srp54P14576 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms