Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnp2P11378 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms