Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PolP10400 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PolP10400 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PolP10400 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PolP10400 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PolP10400 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PolP10400 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PolP10400 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PolP10400 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PolP10400 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PolP10400 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PolP10400 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PolP10400 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PolP10400 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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