Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatspereP0DP43 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatspereP0DP43 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms