Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp1P08042 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms