Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spta1P08032 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Spta1P08032 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spta1P08032 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spta1P08032 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms