Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csf1P07141 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csf1P07141 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms