Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TnfP06804 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TnfP06804 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TnfP06804 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TnfP06804 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms