Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd4P06332 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms