Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06321 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06321 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P06321 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P06321 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P06321 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P06321 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06321 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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