Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrbP05622 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrbP05622 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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