Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-AaP01910 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms