Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01809 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01809 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01809 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01809 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P01809 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01809 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01809 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01809 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01809 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms