Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01740 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01740 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01740 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01740 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms