Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01679 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01679 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01679 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01679 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01679 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01679 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01679 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01679 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01679 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01679 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01679 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms