Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01667 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01667 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01667 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01667 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01667 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01667 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01667 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01667 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01667 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms