Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01662 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01662 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01662 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01662 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms