Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01661 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01661 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01661 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01661 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms