Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Best1O88870 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Best1O88870 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Best1O88870 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Best1O88870 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Best1O88870 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Best1O88870 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Best1O88870 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Best1O88870 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Best1O88870 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Best1O88870 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Best1O88870 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Best1O88870 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms