Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcn3O88705 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms