Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnmt3bO88509 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms