Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme6O88425 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme6O88425 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nme6O88425 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nme6O88425 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme6O88425 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nme6O88425 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nme6O88425 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme6O88425 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme6O88425 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme6O88425 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme6O88425 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme6O88425 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme6O88425 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms